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上传时间: 2021-02-13
详细说明:稳健而准确的反卷积(RAD)
介绍
RAD是一种工具包,可将大量肿瘤样本分离。 给定一个非负的批量RNA表达矩阵B \in R_+^{mxn} ,其中每一行i是一个基因,每一列j是一个肿瘤样本,我们的目标是推断一个表达谱矩阵C \in R_+^{mxk} ,其中每列l是一个单元社区,以及一个分数矩阵F \in R_+^{kxn} ,使得:
B ~= C F.
更具体地说,RAD解决了以下问题:
min_{C, F} || B - C F ||_{Fr}^2,
s.t. C_{il} >= 0, i=1,...,m, l=1,...,k,
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