文件名称:
PopGenomics_Afumigatus_Global:2021年烟曲霉种群基因组学重新启动-源码
开发工具:
文件大小: 33kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-13
详细说明:PopGenomics模板
在简单的BASH + Slurm环境中调用人口基因组学变体的模板。 最好的用途是将其作为模板。
替代管道将引入snakemake实施。
该管道使用Slurm arrayjobs在整个集群中分配工作。 有2个维度需要考虑,一个是在每个菌株/样本之间划分,另一个是每个染色体(或染色体块)的单独工作A
作为此模板的一部分,已经创建了一个logs文件,以支持存储运行的日志文件并保持文件井井有条
需要更新的文件
samples.csv-这是样本列表,第一行是标头,作业将跳过。
config.txt-对种类运行和数据格式进行了几种自定义(我们使用CRAM作为默认存储而不
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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