文件名称:
rust-bio-tools:基于Rust-Bio的一组命令行实用程序-源码
开发工具:
文件大小: 2mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-13
详细说明:Rust生物工具
一套基于Rust-Bio的超快速和强大的命令行实用程序,用于生物信息学任务。 Rust-Bio-Tools提供了一个命令rbt ,该命令当前支持以下操作:
两个vcf / bcf文件的模糊匹配的线性时间实现( rbt vcf-match )
一个vcf / bcf到txt转换器,可灵活地选择标签并正确处理多等位基因位点(rbt rbt vcf-to-txt )
线性时间轮询FASTQ拆分器,用于将给定的FASTQ文件拆分为给定数量的块( rbt fastq-split )
在给定的基因座( rbt bam-depth )下,从BAM提取深度信息的线性时间
一个实用程序,可以从FASTQ文件中快速过滤记录( rbt fastq-filter )
使用标记的重复项(分别是唯一的分子标识符(UMI))将BAM或FASTQ读数合并的工具(rbt rbt collaps
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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