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GAIN-GTEx：带有生成对抗性插补网络的基因表达插补-源码
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文件大小: 1mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-13
详细说明：带有生成对抗性插补网络（GAIN-GTEx）的基因表达插补
该存储库包含论文《的代码
作者： RamonViñas，Tiago Azevedo，Eric R. Gamazon和PietroLiò
抽象的
基本生物学意义的问题是，基因子集的表达可在多大程度上恢复完整的转录组，这对生物学发现和临床应用具有重要意义。 为了解决这一挑战，我们提出了基于增益对抗插补网络的基因表达插补方法GAIN-GTEx。 为了提高我们方法的适用性，我们利用了GTEx v8的数据，GTEx v8是一种参考资源，已从多种人体组织中生成了完整的转录组。 我们将模型与几种标准和最新的插补方法进行了比较，结果表明，GAIN-GTEx在预测性能和运行时间方面均明显优越。 此外，我们的结果表明，在不同缺失水平上，来自3种癌症类型的RNA-Seq数据具有很强的概括性。 我们的工作可以促进将大规模RNA生物存储库经济有效地整合到
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