文件名称:
SCDC：SCDC项目，最初位于：https：github.commeichendongSCDC。 支持稀疏矩阵等-源码
开发工具:
文件大小: 136mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-12
详细说明：SCDC：通过多个单细胞RNA测序参考的大容量基因表达反卷积
SCDC是用于批量的方法，它利用了来自多个参考数据集中的细胞类型特异性基因表达。 SCDC采用ENSEMBLE方法来整合来自不同实验室，在不同时间产生的不同scRNA-seq数据集的去卷积结果，从而隐含地解决了混淆问题。
安装
您可以使用以下命令从安装发布的SCDC版本：
if ( ! require( " devtools " )) {
install.packages( " devtools " )
}
devtools :: install_github( " meichendong/SCDC " )
小插图
请参阅。
SCDC论文发表。
当前存储库的注释
该存储库是的副本。 它包含以下修改：
与稀疏矩阵的兼容性，使用：R中的dgCMatrix对象。
具有并行化的例程
标记选择的动态阈值
日志等方面的改进。
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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