文件名称:
diffUTR:diffUTR R软件包简化了差异外显子使用情况(DEU)分析,并利用现有的DEU工具和替代的聚腺苷酸位点数据库来进行差异3'UTR使用情况分析-源码
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文件大小: 794kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-12
详细说明:diffUTR
简化差异外显子和3'UTR使用情况分析
diffUTR R软件包可简化差异外显子使用情况(DEU)分析,并利用现有的DEU工具和替代的聚腺苷酸位点数据库来进行差异3'UTR使用情况分析。
, 尤其是包提供了流行的基于bin的DEU方法。 但是,对于没有经验的用户来说,使用它们并不容易,其结果通常很难解释。 因此,我们开发了一种简单的工作流程(图1A),可用于这三种方法中的任何一种,但可以标准化输入和输出。 尤其是,bin批注和量化以及不同的使用结果都存储在,这有助于数据存储和浏览,并且无论采用哪种底层方法,都可以启用高级绘图功能。 diffUTR还提供了limma::dif
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