文件名称:
CRISPR工具：CRISPR屏幕分析管道-源码
开发工具:
文件大小: 36mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-12
详细说明：CRISPR屏幕生物信息流水线
该生物信息学管道将自动执行来自CRISPR-Cas9筛选实验的NGS数据分析。 它使用MAGeCK进行统计分析。
软件依赖项：
Python 3
大熊猫
脾气暴躁的
Matplotlib
海生
[R
快速质量控制
多质量控制
领结2
Cutadapt
Pigz（如果未安装，将使用gunzip，但速度会较慢）
麦格克
说明：
从命令行安装：
git clone https://github.com/niekwit/CRISPR-tools.git
为包含子文件夹raw-data的分析创建一个主文件夹（可以是任何名称），该子文件夹包含fastq.gz文件。
导航至命令行中的分析文件夹，然后键入： path/to/crispr-pipeline.sh [ -l ] [ -n O
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
相关说明
- 本站资源为会员上传分享交流与学习,如有侵犯您的权益,请联系我们删除.
- 本站是交换下载平台，提供交流渠道，下载内容来自于网络，除下载问题外，其它问题请自行百度。
- 本站已设置防盗链，请勿用迅雷、QQ旋风等多线程下载软件下载资源，下载后用WinRAR最新版进行解压.
- 如果您发现内容无法下载，请稍后再次尝试；或者到消费记录里找到下载记录反馈给我们.
- 下载后发现下载的内容跟说明不相乎，请到消费记录里找到下载记录反馈给我们，经确认后退回积分.
- 如下载前有疑问，可以通过点击"提供者"的名字，查看对方的联系方式，联系对方咨询.
