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文件大小: 10mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-12
详细说明：样品
培训数据工作流程
1000个基因组高覆盖度补习班
下载在high_coverage索引上列出的Cram索引（.crai）ftp://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/data_collections/1000_genomes_project/1000genomes.high_coverage.GRCh38DH.alignment.index
与GRCh38参考基因组比对
获取SV呼叫集VCF（使用GRCh38参考）
提取DEL / Non-DEL区域用于训练集
bcftools view -i ' SVTYPE="DEL" ' $VCF \
| bcftools query -f ' %CHROM\t%POS\t%INFO/END[\t%SAMPLE,%GT]\n ' \
| python sample_del.py > $
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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