文件名称:
mdnetworktools:MDNetworkTools是一个python软件包,可直接从分子模拟中构建动态网络-源码
开发工具:
文件大小: 45kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-11
详细说明:MDNetwork工具
MDNetworkTools是一个多合一的python程序包,可直接从分子动力学轨迹构建网络。 此外,该软件还提供了用于网络分析(社区检测和次优路径计算)以及可视化的功能。 MDNetworkTools的核心是利用多个Python模块。 轨迹和拓扑处理由MDTraj完成,而网络生成算法通过Numba软件包采用jit编译方法。 目前,只有网络生成方法才能受益于Numba的提速,尽管将来的版本可能会将其扩展到网络分析算法。 请参阅必需的软件包以获取必需软件的完整列表。
必需的包裹
除了numpy和scipy,还需要在运行MDNetworkTools之前安装以下软件包:
M
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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