文件名称:
MetaCyto:用于细胞计数数据的荟萃分析的R包-源码
开发工具:
文件大小: 1mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-11
详细说明:介绍
MetaCyto是一种R软件包,可对流式细胞术和大规模细胞术(CyTOF)数据进行荟萃分析。 它能够使用不同的标记集共同分析来自不同研究的细胞计数数据。 MetaCyto分四个步骤进行荟萃分析:数据收集,数据预处理,在研究和统计分析中识别常见的细胞亚群。 除了执行荟萃分析外,它还可用于分析来自单个实验的细胞计数数据。
安装
方法1:请使用以下代码安装依赖项:
install.packages(c("dplyr", "tidyr", "fastcluster", "ggplot2", "metafor", "cluster"))
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("flowCore")
biocLite("FlowSOM")
安装所有依赖项后,请下载整个程序包存储库,打开“ MetaCyto.Rproj”文件
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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