文件名称:
TESSA：映射TCR曲目的功能范围-源码
开发工具:
文件大小: 26mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-11
详细说明：泰莎
介绍
Tessa是将T细胞受体（TCR）序列分析与T细胞转录组整合的贝叶斯模型。 通过最近开发的同时提供每个T细胞的TCR序列和RNA序列的单细胞测序技术，Tessa绘制了TCR谱库的功能图谱，并产生了理解人类对疾病的免疫React的见识。 作为tessa的第一部分，在贝叶斯算法之前采用BriseisEncoder来捕获TCR序列特征并创建数值嵌入。 有关更多详细信息，请参阅我们的论文： ，Zhang，Z.，Xiong D.，Wang，X.等。 2021。
寻找更多生物信息学工具的研究人员，请访问我们的实验室网站： : 。
使用说明
tessa算法在python和R中实现。我们建议用户使用Linux shell命令执行python脚本。
依存关系
Python（版本3.6.4），R（版本3.5.1以上），Linux（x86_64-redhat-linux-gn）Shell（4
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