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上传时间: 2021-02-10
详细说明：更新：我最近做了一个快速更新。 我个人一直在使用GOPY来生成PDB文件，然后将其导入xleap / AmberTools。 对于氧化石墨烯（GO），环氧基包含两个碳原子，在GOPY中均使用相同的名称“ CY”。 我最近发现，给第二个使用不同的名称会更好，因此现在将第二个命名为“ CZ”。 如果您希望它们都为“ CY”，请更改代码或打开文本编辑器，然后将所有“ CZ”更改为“ CY”。 稍后，我将对此进行完善（检查错误等）。 我这样做是因为当我使用xleap时，我为石墨烯原子，COOH残基，环氧残基和羟基残基定义了一个lib文件，并且“ bondbydistance”命令以这种方式更好地工作。 如果您需要帮助，有任何疑问或正在寻求合作，请给我发 。 我愿意帮忙！ 另外，请通过以下检查我的researchgate个人资料： : 。
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