文件名称:
CMARRT_python:用于峰值调用的CMARRT算法的Python实现-源码
开发工具:
文件大小: 15kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-10
详细说明:CMARRT算法的Python实现
该算法最初是为分析ChIP芯片数据而开发的:
Kuan PF,Chun H,Keles S. CMARRT:一种通过整合相关结构来分析切片阵列中ChIP芯片数据的工具。 Pac Symp生物计算。 2008; 515–526。
在这里,我已经将该算法修改为可用于任何连续数据向量(即log2(提取/输入)ChIP-seq数据)。 该算法目前一次只能处理一个染色体的数据。
用法和参数摘要
usage: run_cmarrt.py [-h] [-p P] [-o O] [-q Q] [-s S]
[--resoluti
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