文件名称:
crosscheckFingerprints：WDL密码运行示例交换检测工具-源码
开发工具:
文件大小: 7kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-10
详细说明：crosscheck指纹
使用Picard 一组文件中的所有遗传数据是否看起来都来自同一个人
总览
依存关系
用法
克伦威尔
java -jar cromwell.jar run crosscheckFingerprints.wdl --inputs inputs.json
输入项
必需的工作流程参数：
参数
值
描述
inputs
数组[文件]
要指纹的SAM / BAM / VCF文件列表。
haplotypeMapFileName
串
列出一组SNP的文件名，可以选择将其排列在高LD块中以用于指纹识别。
可选的工作流程参数：
参数
值
默认
描述
haplotypeMapDir
串
“ $ CROSSCHECKFINGERPRINTS_HAPLOTYPE_MAP_ROOT”
包含单元型映射文件的目录。 默认情况下，调制器数据目录。
outputPrefix
串
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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