文件名称:
seeqR：方便的函数集合，可使用已发布的R包分析NGS数据-源码
开发工具:
文件大小: 1mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-09
详细说明：SeeqR
使用已发布的R包收集方便的函数来分析NGS数据
正常RNA-Seq分析
在开始之前，该包的这一部分依赖于DESeq2包。 查看他们的插图： ：
起始材料：原始计数表，例如来自featureCounts的输出。 seeqR软件包提供了一个示例表（sqCounts）
library(seeqR)
counts <- sqCounts
head(counts)
我们让软件包DESeq2根据原始计数计算差分表达式。 seekDEseq函数包括所有必需的步骤。 从计数表的同名中，我们可以看到条件A有3个样本，条件B有4个样本，还有条件C有4个样本。 我们要比较conditio
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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