文件名称:
PhyloRank:根据进化差异分配分类等级-源码
开发工具:
文件大小: 179kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-09
详细说明:PhyloRank
如果您希望根据所使用的方法对基因组进行分类,我们建议使用我们的配套工具代替PhyloRank。 PhyloRank旨在帮助从细菌或古细菌域的基因组推断出的树木的人工分类管理。
PhyloRank提供了一些功能,可用于计算树木中分类单元的相对进化差异(RED)以及查找树木中分类标签的最佳位置。 其他功能正在开发中,目前不受支持。
安装
安装此软件包的最简单方法是通过pip:
须藤点安装phylorank
该软件包使用了 , , 和 Python库。 这些必须分开安装。 PhyloRank还使用已显式添加到此程序包中的 。 它还需要biolib(> = 0.1.0),但是如果通过pip进行安装,它将与PhyloRank一起安装。
PhyloRank需要从v0.1.0开始的Python 3
计算RED
PhyloRank可以计算树中的分类单元的相对进化差异(RE
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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