文件名称:
MiMiC：最小的微生物联盟创建工具-源码
开发工具:
文件大小: 923kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-09
详细说明：MiMiC
最小的微生物联盟创建工具
什么是MiMiC？
MiMiC从给定的宏基因组样本的功能潜力中提出了最小的微生物联盟。 这是通过产生样品中所有Pfams的二元载体（存在，不存在）并再次将其与我们预先计算的基因组数据库进行比较来完成的。 通过迭代过程，选择功能最符合宏基因组样本的基因组。 一旦考虑了所有功能，或其他基因组的添加不再占Pfams，该过程便会中止，并向用户提供列表和统计信息供选择。
我们希望该工具将导致下一代益生菌以及对微生物群落的基础研究能够进一步采用和使用最小限度的微生物群落。
安装
在安装Protologger之前，必须先安装以下所有依赖项。
MiMiC使用的必须安装的其他R模块是：
dplyr
皮尔
拐点
tidyverse
ggplot2
塔里克斯
阅读器
一旦安装了牛仔装，用户可以通过运行以下命令来测试安装；
待定
运行MiMiC
MiMiC
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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