文件名称:
DGP-PrGeFNE：PrGeFNE：通过快速网络嵌入预测疾病相关基因-源码
开发工具:
文件大小: 16mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-09
详细说明：Ge
描述： 鉴定疾病相关基因对于理解疾病的分子机制以及疾病的诊断和治疗非常重要。 已经提出了许多用于预测疾病相关基因的计算方法，而如何充分利用多源信息（例如疾病-表型关联和蛋白质-蛋白质相互作用）来提高疾病-基因预测的性能仍是一个开放的问题。问题。 在这里，我们提出了一种通过使用快速网络嵌入（PrGeFNE）来预测疾病相关基因的新方法。 具体而言，首先通过使用疾病-基因，疾病-表型，蛋白质-蛋白质和基因-GO关联构建异质网络。 通过快速网络嵌入算法从异构网络中提取节点的低维向量表示。 然后，使用低维向量表示重建双层异构网络，并将网络传播应用于双层异构网络以预测疾病相关基因。 通过5倍交叉验证和新添加的关联验证，我们展示了不同类型的关联数据在增强疾病基因预测能力方面的重要作用，并且通过与最新状态进行比较，证实了PrGeFNE的出色性能。艺术算法。 此外，我们开发了一个网络工具，以方便研究
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