文件名称:
Ahrenslab_data_processing-源码
开发工具:
文件大小: 16kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-09
详细说明:Ahrenslab_data_processing
此存储库用于在Ahrens实验室中对全脑斑马鱼数据进行细胞细分处理。
如果要处理他或她的数据,请更新data_list.csv文件(如下所示)。 在监控data_list.csv的更新时,将定期扫描该存储库并处理数据。
data_list.csv必要信息
dat_dir :原始数据(在h5 )所在的文件夹; 相机信息文件应放在同一文件夹中
save_dir :处理后的数据所在的文件夹; 请以/nrs/ahrens/Ziqiang/Fish_Datasets/
Processed :对于未处理的数据为False
cameraNoiseMat :相机矩阵文件-请与weiz // janelia hhmi org联系以获取正确的文件位置。
singlePlane :True:单平面数据; False:多平面数据
baseline_wi
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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