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DenseLD：这是一种遗传精细映射方法，在目标基因组区域的SNPS中结合了连锁不平衡（LD）矩阵的致密LD块结构-源码
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文件大小: 998kb
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上传时间: 2021-02-09
详细说明：具有致密连锁不平衡区（DenseLD）的遗传精细映射
这是一种遗传精细映射方法，在目标基因组区域的SNPS中结合了连锁不平衡（LD）矩阵的致密LD块结构。
先决条件
分析需要MATLAB。 “ denseLD.m”是用于密集块检测的MATLAB函数，该函数最初来自先前程序包的“ NICE.m”。 “ denseLD.m”比“ NICE.m”具有更快的功能。 密集LD块检测可以在MATLAB中执行，也可以由R使用R包中的函数“ dense_block”来调用。
DenseLD还需要R包genlasso，图形和R.matlab进行分析。 在分析之前，请安装这些软件包。
DenseLD分析实例
DenseLD_demo.html展示了使用DenseLD对模拟样本数据执行精细映射的示例。 demo_mat.html是使用MATLAB函数“ denseLD”进行密集LD块结构检测的示例。
实作
1
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