文件名称:
DomFun：使用蛋白质结构域和功能注释之间的关联进行蛋白质功能预测-源码
开发工具:
文件大小: 32kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-09
详细说明：DomFun
DomFun是使用系统方法将功能分配给未知蛋白质的新系统，而无需考虑其序列但其功能域与功能系统相关联。 它使用在蛋白质结构域和功能注释之间计算的关联作为训练数据集，并通过查找蛋白质的结构域以及它们是否已与功能注释（在GO分子功能，生物学过程，KEGG和Reactome途径术语中）相关联，对蛋白质进行预测（使用UniProt标识符）。 ）。
安装
将此行添加到您的应用程序的Gemfile中：
gem 'DomFun'
然后执行：
$ bundle
或自己安装为：
$ gem install DomFun
用法
要使用DomFun，有必要计算蛋白质结构域和功能注释之间的关联。 为此，请使用NetAnalyzerRubygem（ ），选择最适合您数据的关联索引。 一旦计算出这些关联，它们将用于训练DomFun并预测一组功能未知的蛋白质（赋予UniProt标识符）。
在
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