文件名称:
seqcover:seqcover允许用户查看数百个基因和数十个样本的覆盖范围-源码
开发工具:
文件大小: 51kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-08
详细说明:seqcover是用于查看和评估覆盖深度的工具,其目的如下。 这应该:
显示全局视图,轻松查看有问题的样本和基因
提供交互式的基因角度视图,以探索每个基因内单个样本的覆盖特征
不需要服务器(一个HTML页面)
对多达20个样本* 200个基因有React,对于单个样本有用,
根据任意数量的(摘要)背景样本突出显示异常样本
它可以作为静态linux二进制文件使用。
示例输出
用法
seqcover可以接受或bgzipped bedgaph格式的按库覆盖文件。 可以输出这些格式中的任何一种,但是d4格式将更快。
生成报告:
# generate per base depth files i
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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