文件名称:
bioinformatics_util:Morrison实验室的常用脚本和工具-源码
开发工具:
文件大小: 6mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-08
详细说明:bioinformatics_util
草案
该.R包含R中所有常用的数据处理和分析功能。
plot_script
该目录包含示例draft.R的用法,以及R中的绘图/处理脚本。
align.py
该python3脚本用于使用bowtie2,bwa,STAR和hisat2对齐单端/成对的fastq文件。 相应地更改fastqs,alliger和slurm作业详细信息路径的标题。
runMELT.py
此python3脚本用于为目录中的所有.bam文件提交单独的slurm作业 。
tradseq_to_repenrich2.sh
该Shell脚本将处理通过内部排序方法(Devin Kin
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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