文件名称:
infercnvpy:从scRNA-seq数据推断拷贝数变异(CNV)。 与Scanpy完美搭配-源码
开发工具:
文件大小: 4mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-07
详细说明:infercnvpy:Scanpy插件可从单细胞转录组学数据推断拷贝数变异(CNV)
Infercnv是可扩展的python库,用于从单细胞转录组学数据推断出拷贝数变异(CNV)事件。 它受InferCNV的启发,但是与很好,并且可伸缩性更高。
警告:
该软件包仍处于实验阶段。 该结果未经验证,只是它们看起来与InferCNV的结果相似但不相同。
我们很高兴收到反馈,欢迎您提供帮助!
入门
请参考。 特别是
和
。
安装
您需要在系统上安装Python 3.8或更高版本。 如果您没有安装Python,建议您安装 。
安装infercnvpy的方法有几种:
从安装最新版本的infercnvpy:
pip install infercnvpy
安装最新的开发版本:
pip install git+https://github.com/icbi-lab/infercnvpy.gi
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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