文件名称:
NextGenerationSequencing：构建一个流程以基于R，Perl和Python分析NGS数据-源码
开发工具:
文件大小: 89kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-05
详细说明：下一代测序工作流程
需求
Python 2.7
Perl 5v22
R 2.3
NGS分析中的工作流程
描述
码
描述
extractLargeData.pl
根据策略提取配对的读段。 输入是由领结程序从对齐的SAM分割的文件（由于内存的限制）。
getLargeData.pl
从所有分割的文件中统计每个笔录，并生成一个包含笔录及其读取计数的文件。 由于内存的限制，输入文件的计数将动态更改。
cbnCT.pl
为了合并由代码getLargeData.pl生成的控制文件和处理文件，脚本级别的数据将同时显示控制文件和处理程序的读取计数。
preprocess.py
该代码组合了（
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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