文件名称:
vargeno：从全基因组测序数据中快速准确地进行SNP基因分型，以进行床边诊断-源码
开发工具:
文件大小: 21mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-05
详细说明：瓦吉诺
用于全基因组测序数据和大型SNP数据库的Fase SNP基因分型工具。
从Bioconda安装
可以使用命令conda install vargeno从Bioconda conda install vargeno 。
请转到以获取有关Bioconda的更多信息。
如果您尚未 ，则可以 。
快速使用
VarGeno作为输入：
FASTA文件格式的参考基因组序列。
以VCF文件格式进行基因分型的SNP列表。
以FASTQ文件格式从供体基因组测序测序。
在对个体进行基因分型之前，必须使用以下命令为参考和SNP列表构建索引：
vargeno index ref.fa snp.vc
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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