文件名称:
catch：用于设计紧凑而全面的捕获探针套件的软件包-源码
开发工具:
文件大小: 767kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-05
详细说明：捕捉·
靶标的紧凑聚集，以实现全面杂交
CATCH是一个Python软件包，用于设计探针集以用于捕获各种序列的核酸。
全面覆盖：CATCH接受任何未比对序列的集合，通常是一种或多种微生物物种所有已知遗传多样性的全基因组。 它设计了寡核苷酸序列，可确保覆盖这种多样性，从而可以针对可定制的目标快速设计详尽的探针组。
紧凑的设计：CATCH可以在指定的寡核苷酸数量（例如阵列大小）约束条件下进行设计。 它搜索可能集合许多物种的探针集空间，以找到最佳设计。 这使得它的设计可以随着已知的遗传多样性很好地扩展，并且还支持具有成本效益的应用。
灵活性：CATCH支持的应用范围不限于全基因组富集，例如物种
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