文件名称:
peax：Peax是一种基于自动编码器的无监督表示学习的交互式视觉模式搜索和探索表观基因组数据的工具-源码
开发工具:
文件大小: 13mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-05
详细说明：皮克斯
使用无监督的深度表示学习的表观基因组数据的可视模式浏览器
表观基因组数据表达了丰富多样的模式，可帮助识别调控元件，如启动子，增强子等。但是，要在全基因组范围内可靠地找到这些模式是一项挑战。 Peax是一种基于卷积自动编码器的无监督表示学习，用于交互式视觉模式搜索和表观基因组模式探索的工具。 视觉搜索由手动标记的基因组区域驱动，用于主动学习分类器以反映您的兴趣概念。
引用： Lekschas等， ，计算机图形学论坛，2020，doi： 。
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安装
要求：
> = 4.8
安装：
git clone https://github.com/Novartis/pe
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