文件名称:
deepvariant:DeepVariant是一个分析管道,使用深度神经网络从下一代DNA测序数据中调用遗传变异-源码
开发工具:
文件大小: 31mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-04
详细说明:深变体
DeepVariant是一个基于深度学习的变体调用程序,它接受对齐的读取(BAM或CRAM格式),从中读取堆积图像张量,使用卷积神经网络对每个张量进行分类,最后将结果报告为标准VCF或gVCF文件。
DeepVariant支持二倍体生物中的种系变异调用。
或NGS(Illumina)数据。
PacBio HiFi数据,请参阅。
混合PacBio HiFi + Illumina WGS,请参阅。
牛津纳米Kong使用长期读取数据。
通过使用的GenapSys数据。
另请注意:
对于体型数据或基因型超过两个DNA拷贝的任何其他样品,DeepVariant将无法立即使用,因
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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