文件名称:
librtd：广义k-mer返回时间分布（RTD）计算库-源码
开发工具:
文件大小: 20kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-04
详细说明：librtd
该项目旨在使DNA和RNA k- mer的返回时间分布分析变得简单，快速和通用。
什么是k聚体返回时间分布？
考虑DNA序列AAAAAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTTTTTTTTTT和ATATATATATATATATATATATATATATATATAT 。 基于常规k聚体频率的分析方法将相同地对待这些序列。 当k = 1时，两个序列中的A 1单体的数量恰好等于T 1单体的数量。 但是， k- mer返回时间方法提出以下问题：对于给定的k- mer，它与下一次出现的另一个k- mer（通常是同一对）的距离（以碱基对计）有多近。
因此，回到上面的示例，对于k = 1，
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