文件名称:
calciumImagingAnalysis：CIAtah（发音为印度豹）或calciumImagingAnalysis（ciapkg）：用于对单光子和双光子成像数据集进行钙成像分析的软件包。 文档：https：git.iociatah_d
开发工具:
文件大小: 19mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-04
详细说明：CIAtah
完整文档位于
CIAtah （发音为猎豹；以前C 铝一世maging 一个nalysis（ciapkg））是用于分析单光子和双光子钙成像数据集的软件包。
CIAtah功能：
一个具有不同模块的GUI，允许用户执行大型批处理分析，可通过存储库的ciatah类进行访问。
ciatah函数可用于创建无GUI且支持命令行的分析管道。 函数位于ciapkg和+ciapkg子文件夹中。
包括所有主要的钙成像分析步骤：电影可视化（包括从磁盘读取），预处理（运动校正，时空下采样，空间滤波，相对荧光计算等），支持多种细胞提取方法（CELLMax，PCA- ICA，CNMF，CNMF-E，
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