文件名称:
欧氏距离变换3d:使用行进抛物线的多标签3D各向异性图像的欧氏距离变换-源码
开发工具:
文件大小: 3mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-01-29
详细说明:多标签各向异性3D欧氏距离变换(MLAEDT-3D)
计算一次包含多个标签的1d,2d或3d标签图像的欧几里德距离变换,并支持各向异性尺寸。 好奇输出是什么样子? 下载!
import edt
import numpy as np
# e.g. 6nm x 6nm x 30nm for the S1 dataset by Kasthuri et al., 2014
labels = np . ones ( shape = ( 512 , 512 , 512 ), dtype = np . uint32 , order = 'F' )
dt = edt . edt (
labels , anisotropy = ( 6 , 6 , 30 ),
black_border = True , order = 'F' ,
parallel = 4 # number of threads, <= 0 sets to num cpu
)
用例
同时计算包含多个标签的体积的距离变换,然后使用快速遮罩运算符查询它。
使用遮罩运算符将多标签体积转换为二进制图像(即单个标签),然后计算普
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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