文件名称:
AB_barcodes:代码以生成与Visium空间转录组学兼容的DNA偶联抗体的抗体条形码-源码
开发工具:
文件大小: 44kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-04-02
详细说明：AB_条形码
编码以生成与Visium空间转录组学兼容的抗体条形码。
为了使用来自10x基因组学的Visium空间基因表达溶液使用DNA偶联抗体对蛋白质进行多重分析，需要生成与空间条形码不重叠的AB条形码以区分这两组条形码。
这里已为此目的生成了代码，特别是：
n个随机生成的长度为l的条形码（此处为100个16核苷酸长度的条形码）
任何AB条码与任何Visium空间条码之间的汉明距离至少为6
任何AB条码与任何其他AB条码之间的汉明距离至少为7
GC含量与Visium空间条形码在同一范围内（25％-75％）
任何AB条码的不超过3个相应碱基
依存关系
的Python 3.8.5
脾气暴躁的1.19.2
其他版本的Python和Numpy也可能有效
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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