文件名称:
garcia_and_lohmueller_2020:Garcia和Lohmueller 2020的剧本-源码
开发工具:
文件大小: 39mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-04-01
详细说明:Garcia和Lohmueller 2020
Garcia和Lohmueller 2020的剧本
使用SLIM VCF计算Hrj
为了计算VCF的Hrj,我们使用了基于R的脚本,标题为:“ computing_hrj_slim.R”。
它们是功能get_configuration_table()所需的七个参数:
variant_type(integer)=这是待分析的苗条中使用的突变类型。 在我们的模拟中,我们使用了三种突变类型(1 =非同义的,2 =同义的和3 =互基因的)。 要研究非同义突变,此参数应为1。
allele_count(整数)=这是要分析的样品中的等位基因计数。 为了研究doubleton(样本中出现两次的变量),参数应为2。
染色体(整数)=此值表示苗条模拟的染色体数。 对于苗条3,此值应为1。
recombinationRate(float)=要注释数据
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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