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PS-V2N:这是一种最短的基于路径的算法，称为PS-V2N（顶点到网络的接近分数），被提出用于目标识别-源码
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文件大小: 3mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-04-01
详细说明：通过PS-V2N方法进行基因优先排序（通过PS-V2N.R ）
这是一种称为PS-V2N（顶点到网络的邻近分数）的基于最短路径的算法，被提出用于目标识别。 这是我们的工作流程：
1 。 之前工作
计算之前，准备好一个txt / csv文件（例如MSPPIN_vertex.csv ），第一列是基因名称，第二列是类型标识码0、1和2（0表示groupB，1表示maens groupA，2表示共享基因）； 准备好您的边缘网络文件（例如MSPPIN_edge.csv ）
2 。 我们的方法可以概括为四个步骤：
①将网络中的基因分为A和B子群;
②从A中选择基因vi ，从B中选择所有基因;
③在步骤2）中保持所选基因之间的边缘，以构建子网络Gsub ；
④计算Gsub中基因vi的邻近度。
3 。 运行PS-V2N.R，然后将获得一个按PS-V2N值排序的表列表，结果如下：
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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