文件名称:
ImageJ-Tools:核分割和比例定量-源码
开发工具:
文件大小: 9mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-31
详细说明:ImageJ工具
核分割(Alpha)
分割工具由DoG过滤器工作,然后由Otsu生成二进制图。 然后,我使用分水岭来分割对象,但是3D分水岭使它变得过于严重,并导致许多核丢失,许多核的收缩比原始尺寸小得多。
通过将我的分水岭图与未分水岭的二元地图进行比较,我可以创建“丢失核”的地图,以便稍后再添加它们。
我进行了一个连接组件分析,以生成分水岭原子核的标签图,然后将标签图扩大到零像素,仅填充所有空间。 然后,我将其乘以原始阈值图像,以获得具有足够好的分割对象的良好分割效果。 但这会给图像中存在的“核丢失”提供错误的标签。
为了解决这个问题,我在“丢失的核”图上运行了一个连接的组件,以生成标签,并加上OTHER标签图的最大值。 然后,我使用maximumImage将这些标签叠加在另一个标签图上,以获得我的FINAL标签图。
FRETENATOR_Segment_and_ratio(
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