文件名称:
ChIP-AP:染色质免疫沉淀测序分析管线-源码
开发工具:
文件大小: 92mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-31
详细说明:芯片
CH romatin我mmuno P recipitation测序nalysis P ipeline
本质上简单的ChIP-Seq分析
由Jeremiah Suryatenggara和Mahmoud A.Bassal开发
介绍
ChIP-Seq是一种用于分析蛋白质-DNA相互作用并鉴定所述蛋白质的结合位点的技术。 生物信息学分析中的关键步骤是调用“峰”或富集区域,对应于蛋白质与DNA的结合位点。
据广泛报道,在所有生物信息学分析步骤中,最有可能影响研究结果的步骤是峰调用(Chen等,2012; Johnson等,2007)。 已经发表了许多评论(Koohy等,2014; Laajala等,2009; Wilbanks和Facciotti,2010),以高峰呼叫者为基准,以确定一个呼叫者相对于其他呼叫者的优越性。 但是,这些基准始终一致地报告了混合的,可能相互矛盾的发现,没有一个
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