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上传时间: 2021-03-31
详细说明:概述
此存储库包含再现热图所需的所有代码和数据,该图概述了生物膜和持久性大肠杆菌MG 1655数据集(从两个不同的出版物中获得-参见下文)中常见检测到的蛋白质含量的倍数变化。 在此处查看项目背景: :
资料夹结构
码文件夹:包含Python和MATLAB代码,以生成用于生成两个数据集之间的蛋白质共同的表图proteomics_common_Ecoli.py Python代码并保存在持留和生物膜种群作为excel工作表中的数据文件夹中的倍数变化沿常见的蛋白质列表。 common_protein_heatmap.mat matlab代码,用于根据从proteomics_common_Ecoli.py python代码获得的数据生成热图。
数据文件夹:包含生成图形所需的已发布数据,请参见此README.md中的数据部分。 persister_biofilm_common.xls是从上述py
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