文件名称:
biosuite:BioSuite是使用常见细菌基因组学工具的MATLAB函数的集合-源码
开发工具:
文件大小: 49mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-31
详细说明：生物套件
BioSuite是使用常见细菌基因组学工具的MATLAB函数的集合。
描述
严格的生物信息学管道通常需要集成多个工具，每个工具都依赖于具有复杂依赖性的不同语言。 对于具有一种（或更少）编程语言经验的学生和/或没有计算背景的更高级的科学家而言，这些障碍极具挑战性。 BioSuite是许多使用最广泛的细菌基因组学工具的汇编，包括全基因组比对，从头组装，SNP调用和功能注释/分析。 MATLAB包装器为后端源代码提供了一个简单的接口，并利用独立的conda环境来避免依赖冲突。 更高级的用户可以轻松地遵循模板来集成未包含的其他工具。
入门
依存关系
conda
码头工人
所有工具均已在Mac OSX 10.15.5和MATLAB R2019b上进行了测试
正在安装
先决条件
Conda ：请访问下载Conda。 滚动到底部，然后为您的操作系统选择命令行或图形安装程序（两者均应为Pytho
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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