文件名称:
docker-hic-qc:相基因组学Hi-C QC的Docker化-源码
开发工具:
文件大小: 13kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-31
详细说明：Docker中的Hi-C QC
具有丰富的Hi-C质量控制报告。 这是的容器化，可通过Docker Hub公开获得。
用法
docker run \
--rm \
--volume $PWD:/root/results \
--workdir /root/results \
aakashsur/hic_qc \
hic_qc.py \
-b alignment.bam
细节
hic_qc.py命令已放置在$ PATH中。 最简单的运行方法是将所有内容都保存在$ PWD中，即名称排序的.bam文件。 然后，将当前本地目录挂载到容器的主目录中的文件夹/ root / results中。 要获取hic_qc.py的选项，只需docker run --rm aakashsur/hic_qc hic_qc.py --help 。
对于在HPC设置中运行，其中奇异性通常是容
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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