文件名称:
Data_Integration_Exercise-源码
开发工具:
文件大小: 12mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-31
详细说明：Data_Integration_Exercise
初始大纲：
Biol722小组研讨会
Meagan Archer Meghan Pepler Sreedevi Kesavan Stephanie Ali Fairbairn
将RNA-seq与ChIP-Seq整合
我们的模型系统简介（可能来自Elliot实验室的数据-将WT与突变菌株进行比较）RNA-seq管道的简要概述我们有计数表-现在呢？ 缩小感兴趣的差异表达基因的范围ChIP-seq工作流程简介处理ChIP-Seq数据将RNA-seq数据与ChIP-seq整合在一起（我们可能会在本研讨会上重点研究转录因子，但是可以使用相同的过程分析染色质调节剂的ChIP数据）以预测转录因子是否具有激活或抑制功能推断转录因子的靶基因（转录因子对差异表达基因的直接或间接作用）降低假阳性率可能（有时间允许）找到结合位点的序列基序靠近上调或下调的靶
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