文件名称:
pdb_correlation_extraction:从多状态pdb蛋白质坐标中提取相关性-源码
开发工具:
文件大小: 6mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-31
详细说明：pdb_correlation_extraction
从多状态pdb蛋白质坐标中提取相关性
所需软件：
Python3
设置一个新的python环境
python3 -m venv venv
source venv/bin/activate
pip install -r requirements.txt
用以下方法分析您的多状态蛋白质束PDB的相关性
python allosteryExtraction.py bundle_path --nstates=2 --mode=backbone --graphics=True
# Demo example:
python allosteryExtraction.py demo.pdb
参数：
bundle： str，pdb文件的路径
nstates： int，蛋白质状态数，默认= 2
模式： str，变构模式，默认=骨干
可以是以下之一
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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