文件名称:
modelled_systems:收集精心组织的分子系统,以及参考拓扑,坐标,注释和建模说明-源码
开发工具:
文件大小: 719kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-31
详细说明:参考系统
此仓库是参考和规范数据的集合,用于对分子进行计算分析和模拟,包括:
实验结构建模
对接
MD模拟
结构分析和数据挖掘
它被组织成systems文件夹中的“系统”的集合。 下表是文件夹的简要说明和名称。
文件夹的名称应被视为系统的唯一易读易懂的名称,该名称可以在其他情况下用作参考。 此名称称为system_id 。
系统文件夹的结构将在下面给出。
除系统参考数据外,还有一套(WIP)工具,可帮助查询系统数据并将其转换为其他格式。
系统篇
“系统”的定义和其他必要的术语
我们应该弄清系统的含义,以回答“何时启动新系统”这个问题?
就我们的目的而言,系统是感兴趣的化学物质的唯一集合。 这大致对应于一个单一RCSB PDB ID(如6w7o在BTK-cIAP-TL7下面例子)。 这个系统有两个蛋白质和一个小分子,因为这三个主要成分是我们的主要兴趣,我们不会说像结晶水这样的次要成
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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