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上传时间: 2021-03-30
详细说明:coupleCoC +的实现
曾鹏程和林志祥在论文“ coupleCoC +:用于单细胞基因组数据的综合聚类的基于信息理论,基于聚类的转移学习框架”中产生结果的源代码。 该代码包括用于coupleCoC +算法的matlab代码和用于下游分析的R代码。
要求
用于coupleCoC +模型的MATLAB R2019b(包括基于Matlab的基准测试方法coupleCoC和CoC)
用于数据可视化和下游分析的R版本4.0.4(包括基于R的基准方法LIGER,Seurat,SC3,SIMLR等)
安装
要通过基准测试方法重现结果,您还应该安装R软件包,如下所示:
if ( ! requireNamespace( " BiocManager " , quietly = TRUE ))
install.packages( " BiocManager " )
BiocManager ::
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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