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上传时间: 2021-03-29
详细说明：Cryo-RAlib-在cryo-EM中加速对齐
这是一个包含gpu加速的多参考对齐代码的存储库，用于冷冻EM图像处理。 该代码在2020 NCHC GPU Hackathon中使用。
团队成员：，，，，统计科学研究所，中央研究院
导师：Nvidia的Ryan Jeng
多参照比对（类别平均值）
无参考对齐（前10次迭代的平均值）
基准
多参考对齐我们比较了EMAN2的CPU实现，并使用了Ribosome 但下采样至90像素。 下表在 c.super实例上运行。 xr ， yr ， ou ， maxit分别设置为3、3、36、6。
加速比为22x〜37x，具有不同的参考编号。
无参考对齐
下表在 c.super实例上运行。 ts ， ou ， maxit分别设置为1,36,6。
加速速度为2.4x〜9.4x，具有不同的2D偏移。
如何使用图书馆
1.安装
安装EMAN2和Sp
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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