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上传时间: 2021-03-28
详细说明:正则化最佳质量传输(rOMT)在淋巴-淋巴液流中的应用
该项目包括用于(1)rOMT算法(2)淋巴动力学的拉格朗日表示法(GLaD)分析(3)基于邻域的余弦分析(NCA)
(1)在数据集上运行主要的rOMT模型,(2-3)对(1)的结果进行后处理。
系统要求
该代码主要是用Matlab编写和运行的(ROMT算法使用R2018a,后处理使用R2019b),而GLaD分析中的一小部分使用Python 3.7.3运行。
依存关系
Matlab的
(a)NIfTI_analyze 用于加载和导出漂亮的文件(b)vtkwrite 用于将mat导出为vtk格式
Python
numpy,scipy,dipy
推荐的可视化软件
(a)阿米拉6.5.0的速度图(b)用于通量向量的VisIt 3.0.2
演示版
原始的3D MRI数据集(每个大小为100x106x100,共11帧)太耗时且占用大量内存,
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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