文件名称:
anndata:R中带注释的多元观测数据-源码
开发工具:
文件大小: 10mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-27
详细说明:anndata-带注释的数据
是常用的Python软件包,用于跟踪数据和学习的注释,并且可用于读取和写入h5ad文件格式。 它也是scanpy python软件包(Wolf,Angerer和Theis 2018)中使用的主要数据格式。
但是,在R中使用scanpy / anndata可能会很麻烦。 当尝试读取h5ad文件时,R用户可以采用以下两种方法之一来解决此问题。 A)您可以手动读取文件(因为它是H5文件),但这需要大量的手动工作,并且需要对h5ad和H5文件格式的工作方式有很多了解(并且,还要期待因隐藏的hdf5r错误而引起的严重头痛) 。 或B)通过网状结构与scanpy和andata进行交互,但遇到了将某些python对象转换为R的问题。
我们最近在CRAN上发布了 ,它是Python程序包的R包装器-顶部撒有一些语法,使R用户感到宾至如归。
将R anndata仍在于积极
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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