开发工具:
文件大小: 2mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-26
详细说明：SCALE v2：通过潜在特征提取进行单细胞整合分析
安装
从PyPI安装
pip install scale-v2
从GitHub安装
git clone git://github.com/jsxlei/scale_v2.git
cd scale_v2
python setup.py install
SCALE v2在框架中实现。 如果可用，建议在CUDA上运行SCALE v2。 安装仅需几分钟。
快速开始
SCALE v2可以在Jupyter Notebook中的命令行和API函数下使用
1.命令行
SCALE.py --data_list data1 data2 --batch_categories batch1 batch2
选项
-data_list 矩阵文件列表（每个都是batch或单个批处理/批处理合并的文件）。
-batch_categories 批处理批注的类别。 默认
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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