文件名称:
GTEx-Complex-Diseases-源码
开发工具:
文件大小: 10mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-22
详细说明：GTEx-复杂疾病
介绍
尽管可以使用多种技术和策略来识别人类复杂疾病的遗传因素，但是由于复杂疾病是“复杂的”和多因素的，因此这些研究的结果仍然难以解读。炎症最近与许多复杂的疾病有关，并可能对人体造成长期损害。在这里，我们使用基因型组织表达（GTEx）项目的尸检样本检查了复杂疾病的历史是否系统地改变了人类组织的转录组，并且炎症是否在确定的分子标记中富集了。我们比较了有无脑血管病（CVD）或重度抑郁（MD）病史的受试者之间的表达情况，更多细节请参见我们的手稿。
数据探索
v6和v8版本之间的样本编号比较：
有关主题和样本的信息：
CVD：
MD： ，
组织的主坐标分析（PCoA）： PCoA用于基于相似性确定哪些组织可以合并为一组，但随后我们确定不合并组织
组织感知归一化方法比较： 我们决定使用组织感知的分位数归一化
RNA序列分析
前处理
ExpressionSet对象生成： 将
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