文件名称:
scvi-tools:单细胞组学数据的深度概率分析-源码
开发工具:
文件大小: 6mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-21
详细说明：（单细胞变体推断工具）是在和基础上构建的用于单细胞组学数据概率模型的软件包。
单细胞组学模型的可用实现
scvi-tools包含几种模型的可伸缩实现，这些模型可促进许多组学中的大量任务，包括：
用于单细胞RNA数据分析的及其改进的差异表达 。
用于使用半标记示例对scRNA-seq数据进行细胞注释。
用于分析CITE-seq数据的 。
用于从scRNA-seq数据推断空间转录组学中的缺失基因。
用于评估scRNA-seq数据中零充气的基因特异性水平。
用于的可解释线性因子模型版本。
用于空间转录组学数据解卷积的。
peakVI用于分析ATAC-seq数据。
（目前支持scVI，scANVI和TotalVI），用于转移从一个单细胞图谱于查询数据集学习。
用于基于参考的scRNA-seq数据注释。
用于在scRNA-seq数据中进行双峰检测的 。
所有这些实现均具有与交互的高级
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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